| Information | |
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| has gloss | eng: AMBER (an acronym for Assisted Model Building with Energy Refinement) is a family of force fields for molecular dynamics of biomolecules originally developed by the late Peter Kollman's group at the University of California, San Francisco. AMBER is also the name for the molecular dynamics software package that simulates these force fields. It is maintained by an active collaboration between David Case at Rutgers University, Tom Cheatham at the University of Utah, Tom Darden at NIEHS, Ken Merz at Florida, Carlos Simmerling at Stony Brook University, Ray Luo at UC Irvine, and Junmei Wang at Encysive Pharmaceuticals. |
| lexicalization | eng: Amber |
| instance of | c/Force fields |
| Meaning | |
|---|---|
| Japanese | |
| has gloss | jpn: AMBER(Assisted Model Building with Energy Refinement)とは分子動力学のモデルの一つであり、それを実装した分子動力学シミュレーションソフトウェアの呼称でもある。AMBERは，カリフォルニア大学のPeter Kollmanらによって開発され、生体分子を分子動力学で評価する場面でしばしば用いられる。現在はDavid Case(Rutgers大学)，Tom Cheatham(Utah大学)，Tom Darden(NIEHS)，Ken Merz(Florida)，Carlos Simmerling(Stony Brook 大学)，Ray Luo(UC Irvine)，Junmei Wang(Encysive Pharmaceuticals)らにより研究されている。 |
| lexicalization | jpn: AMBER |
| Polish | |
| has gloss | pol: AMBER (Assisted Model Building with Energy Refinement) - pole siłowe stworzone przez zespół Petera Kollmana na University of California, San Francisco. Podobnie jak w przypadku wielu innych pól siłowych, nazwa (AMBER) odnosi się również do pakietu umożliwiającego np. przeprowadzenie dynamiki molekularnej. Pakiet AMBER, w odróżnieniu np. do pakietu CHARMM, jest oprogramowaniem zamkniętym i ma charakter komercyjny. |
| lexicalization | pol: AMBER |
| Chinese | |
| has gloss | zho: AMBER力场是在生物大分子的模拟计算领域有着广泛应用的一个分子力场。开发这个力场的是Kollman课题组，最初AMBER力场是专门为了计算蛋白质和核酸体系而开发的，计算其力场参数的数据均来自实验值，后来随着AMBER力场的广泛应用，包括Kollman在内的很多课题组对AMBER力场的内容不断进行丰富，逐渐开发出了一个可以用于生物大分子、有机小分子和高分子模拟计算的力场体系。但是总体来讲，AMBER力场的优势在于对生物大分子的计算，其对小分子体系的计算结果常常不能令人满意。 |
| lexicalization | zho: AMBER力场 |
| Media | |
|---|---|
| media:img | Bond stretching energy.png |
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